Żydowski Instytut Historyczny działalność edukacyjną rozpoczął w 1992 r. Zapoczątkowały ją wakacyjne, tygodniowe kursy dla nauczycieli szkół średnich, metodyków nauczania i wykładowców wyższych szkół pedagogicznych, zwane „Letnią Szkołą Historii i Kultury Żydów Polskich”. W następnych latach intensyfikowano działalność edukacyjną wśród nauczycieli rozszerzając ofertę o organizowanie m.in. lekcji muzealnych dla młodzieży szkolnej. Główne cele edukacyjne ŻIH to przede wszystkim prezentacja wspólnego dziedzictwa judaizmu i chrześcijaństwa, dezawuacja mitów i stereotypów, zapoznawanie z kulturowym dziedzictwem Żydów polskich, ukazywanie wspólnych wątków historii Żydów i Polaków, analizowanie genezy i przejawów antysemityzmu jako aktualnego problemu społecznego w Polsce oraz metodyka nauczania o wyżej wymienionej tematyce.
W ostatnich latach szczególny nacisk w działalności edukacyjnej ŻIH położono na poszerzanie wiedzy o Holokauście w Polsce. Rozpoczęto współpracę ze SPIRO Institute (obecnie London Jewish Cultural Centre) i zorganizowano kilka cieszących się dużym powodzeniem konferencji dla nauczycieli. Na konferencjach wiodącymi tematami było nauczanie o stosunkach polsko-żydowskich i nauczanie o Holokauście w szkołach średnich, gdzie od niedawna tematyka Holokaustu pojawia się w podręcznikach szkolnych.
W dalszej działalności edukacyjnej pragniemy przede wszystkim zintensyfikować doskonalenie zawodowe nauczycieli w zakresie nauczania historii i kultury Żydów polskich, promować wiedzę na temat historii i kultury Żydów polskich wśród nauczycieli z obszaru całego kraju, podjąć współpracę z regionalnymi ośrodkami doskonalenia nauczycieli w ww. zakresie a osiągnięcia w tej dziedzinie upowszechniać za pomocą różnego rodzaju publikacji.